Summary Seminars en Homework Assignments Voortgezette Statistiek en Methoden van Onderzoek (GZW3024)

GZW3025 – Voortgezette Statistiek en Methoden van Onderzoek




Homework Assignment 1 ............................................................................................................................... 3

Seminar Assignment 1 ................................................................................................................................ 14

Homework Assignment 2 ............................................................................................................................. 16

Seminar Assignments 2 ............................................................................................................................... 19

Homework Assignment 3 ............................................................................................................................. 28

Seminar Assignment 3 ................................................................................................................................ 31

Homework Assignments 4 ........................................................................................................................... 41

Seminar Assignments 4 ............................................................................................................................... 47

Homework Assigment 5 ............................................................................................................................... 52

Seminar Assignments 5 ............................................................................................................................... 56

Homework Assignments 6 ........................................................................................................................... 68

Seminar Assignments 6 ............................................................................................................................... 72

Homework Assignment 7 ............................................................................................................................. 78

Seminar Assignment 7 ................................................................................................................................ 79

Homework Assignment 8 ............................................................................................................................. 88

Seminar Assignments 8 ............................................................................................................................... 90

Homework Assignment 9 ............................................................................................................................. 95

Seminar Assignment 9 .............................................................................................................................. 106

Homework Assignment 10 ......................................................................................................................... 116

Seminar Assignment 10 ............................................................................................................................ 120

Homework Assignment 11 ......................................................................................................................... 130

Seminar Assignment 11 ............................................................................................................................ 137

Homework Assignment 12 ......................................................................................................................... 143

Seminar Assignment 12 ............................................................................................................................ 148

Homework assignment 13 ......................................................................................................................... 162

1

,Seminar Assignment 13 ............................................................................................................................ 170

Homework Assignments 15 ....................................................................................................................... 175

Seminar Assignment 15 ............................................................................................................................ 177

Homework Assignment 16 ......................................................................................................................... 184

Seminar Assignment 16 ............................................................................................................................ 186

Homework Assignment 17 ......................................................................................................................... 193

Seminar Assignment 17 ............................................................................................................................ 202

Homework Assignment 18 ......................................................................................................................... 208

Seminar Assignment 18 ............................................................................................................................ 210

Homework Assignment 19 ......................................................................................................................... 215

Seminar Assignment 19 ............................................................................................................................ 216

Homework Assignment 20 ......................................................................................................................... 219

Seminar Assignment 20 ............................................................................................................................ 226

Homework Assignment 22 ......................................................................................................................... 231

Seminar Assignment 22 ............................................................................................................................ 233

Homework Assignment 23 ......................................................................................................................... 239

Seminar Assignment 23 ............................................................................................................................ 240

Homework Assignment 24 ......................................................................................................................... 249

Seminar Assignment 24 ............................................................................................................................ 252

Seminar Assignment 25 ............................................................................................................................ 258




2

,Homework Assignment 1
Researchers can quantify the occurrence of disease by making use of measures
of disease frequency (MODF), such as
- Prevalence (and variants of this MODF: point, period, and lifetime
prevalence)
- Incidence (and variants of this MODF: cumulative incidence and incidence
density
- Mortality
- Case fatality rate (CRF)

1a. Define all of these MODF. How should one calculate these measures?

Epidemiologische breuk:
- Geeft de frequentie van ziekten (proportie) in de populatie weer
𝑇𝑜𝑡𝑎𝑎𝑙 𝑎𝑎𝑛𝑡𝑎𝑙 𝑧𝑖𝑒𝑘𝑡𝑒𝑛
- 𝐸𝑝𝑖𝑑𝑒𝑚𝑖𝑜𝑙𝑜𝑔𝑖𝑠𝑐ℎ𝑒 𝑏𝑟𝑒𝑢𝑘 = 𝑇𝑜𝑡𝑎𝑎𝑙 𝑎𝑎𝑛𝑡𝑎𝑙 𝑝𝑒𝑟𝑠𝑜𝑛𝑒𝑛 𝑖𝑛 𝑑𝑒 𝑝𝑜𝑝𝑢𝑙𝑎𝑡𝑖𝑒

Prevalentie:
Het deel van de populatie waarbij een bepaalde gezondheidstoestand op een bepaald
tijdstip aanwezig is
- Voor bestaande gevallen
- Heeft betrekking op het aantal personen dat op een bepaald moment ziek is. Dit
aantal wordt dan gedeeld door het aantal personen in de populatie waartoe de
ziektegevallen behoren.
𝑇𝑜𝑡𝑎𝑎𝑙 𝑎𝑎𝑛𝑡𝑎𝑙 𝑧𝑖𝑒𝑘𝑒𝑛 𝑜𝑝 𝑒𝑒𝑛 𝑏𝑒𝑝𝑎𝑎𝑙𝑑 𝑚𝑜𝑚𝑒𝑛𝑡 𝑖𝑛 𝑒𝑒𝑛 𝑏𝑒𝑝𝑎𝑎𝑙𝑑𝑒 𝑝𝑒𝑟𝑖𝑜𝑑𝑒
- 𝑃𝑟𝑒𝑣𝑎𝑙𝑒𝑛𝑡𝑖𝑒 = 𝑇𝑜𝑡𝑎𝑎𝑙 𝑎𝑎𝑛𝑡𝑎𝑙 𝑝𝑒𝑟𝑠𝑜𝑛𝑒𝑛 𝑖𝑛 𝑑𝑒 𝑝𝑜𝑝𝑢𝑙𝑎𝑦𝑖𝑟 𝑤𝑎𝑎𝑟𝑢𝑖𝑡 𝑑𝑒𝑧𝑒 𝑧𝑖𝑒𝑘𝑒𝑛 𝑎𝑓𝑘𝑜𝑚𝑠𝑡𝑖𝑔 𝑧𝑖𝑗𝑛
- Puntprevalentie: Alle leden van een populatie op exact hetzelfde tijdstip
vaststellen (bijna onmogelijk in de praktijk)
o Deel van de populatie die ziek is op een bepaald moment in de tijd
- Periodeprevalentie (in een dynamische populatie) =
𝑇𝑜𝑡𝑎𝑎𝑙 𝑎𝑎𝑛𝑡𝑎𝑙 𝑧𝑖𝑒𝑘𝑒𝑛 𝑖𝑛 𝑒𝑒𝑛 𝑏𝑒𝑝𝑎𝑎𝑙𝑑𝑒 𝑝𝑒𝑟𝑖𝑜𝑑𝑒
𝐺𝑒𝑚𝑖𝑑𝑑𝑒𝑙𝑑𝑒 𝑣𝑎𝑛 𝑑𝑒 𝑡𝑜𝑡𝑎𝑙𝑒 𝑝𝑜𝑝𝑢𝑙𝑎𝑡𝑖𝑒 𝑎𝑎𝑛 ℎ𝑒𝑡 𝑏𝑒𝑔𝑖𝑛 𝑒𝑛 𝑒𝑖𝑛𝑑𝑒 𝑣𝑎𝑛 𝑑𝑒 𝑝𝑒𝑟𝑖𝑜𝑑𝑒
o Deel van de populatie die ziek is binnen een bepaalde periode
- Life-time prevalentie: Deel van de populatie die ziek is gedurende zijn leven

Incidentie:
Het deel van de bestudeerde populatie waarbij een bepaalde ziekte in een bepaalde
periode voor het eerst optreedt
- Voor nieuwe gevallen
- Heeft betrekking op het aantal personen dat ziek wordt in een bepaalde periode.
Men deelt dan deze nieuwe ziektegevallen door het aantal personen in de
populatie aan het begin van die periode
𝑇𝑜𝑡𝑎𝑎𝑙 𝑎𝑎𝑛𝑡𝑎𝑙 𝑛𝑖𝑒𝑢𝑤𝑒 𝑧𝑖𝑒𝑘𝑒𝑛 𝑖𝑛 𝑒𝑒𝑛 𝑏𝑒𝑝𝑎𝑎𝑙𝑑𝑒 𝑝𝑒𝑟𝑖𝑜𝑑𝑒
- 𝐼𝑛𝑐𝑖𝑑𝑒𝑛𝑡𝑖𝑒 = 𝑇𝑜𝑡𝑎𝑎𝑙 𝑎𝑎𝑛𝑡𝑎𝑙 𝑝𝑒𝑟𝑠𝑜𝑛𝑒𝑛 𝑖𝑛 𝑑𝑒 𝑝𝑜𝑝𝑢𝑙𝑎𝑡𝑖𝑒 𝑤𝑎𝑎𝑟𝑢𝑖𝑡 𝑑𝑒𝑧𝑒 𝑧𝑖𝑒𝑘𝑒𝑛 𝑎𝑓𝑘𝑜𝑚𝑠𝑡𝑖𝑔 𝑧𝑖𝑗𝑛
- Bestudeer in populaties waarvan alle leden in principe kandidaten zijn (‘at risk’
zijn) voor de gebeurtenissen in kwestie
- Cumulatieve Incidentie (CI) → Om de kans op ziekte te bepalen

3

, o Bij alle studiedesigns waar een gesloten populatie is
▪ RCT, cohortstudie,
▪ Het moet bij mensen ‘at risk’ zijn, dus de mensen mogen nog niet
ziek zijn
o Alle leden van een cohort worden gedurende een bepaalde tijd gevolgd
o Voorwaarde voor lidmaatschap is dat men ‘at risk’ is op t0, dus men moet
vatbaar zijn voor de aandoening
o Waarde van 0-1 (0-100%)
𝑇𝑜𝑡𝑎𝑎𝑙 𝑎𝑎𝑛𝑡𝑎𝑙 𝑛𝑖𝑒𝑢𝑤𝑒 𝑧𝑖𝑒𝑘𝑒𝑛 𝑖𝑛 𝑒𝑒𝑛 𝑏𝑒𝑝𝑎𝑎𝑙𝑑𝑒 𝑝𝑒𝑟𝑖𝑜𝑑𝑒
o 𝐶𝐼 𝑖𝑛 𝑐𝑜ℎ𝑜𝑟𝑡 = 𝑇𝑜𝑡𝑎𝑎𝑙 𝑎𝑎𝑛𝑡𝑎𝑙 𝑝𝑒𝑟𝑠𝑜𝑛𝑒𝑛 𝑖𝑛 𝑑𝑒 𝑝𝑜𝑝𝑢𝑙𝑎𝑡𝑖𝑒 𝑎𝑎𝑛 ℎ𝑒𝑡 𝑏𝑒𝑔𝑖𝑛 𝑣𝑎𝑛 𝑑𝑒𝑧𝑒 𝑝𝑒𝑟𝑖𝑜𝑑𝑒
- Incidentiedichtheid (ID)
o Bij dynamische populaties en onvolledige follow-up van een cohort
𝑇𝑜𝑡𝑎𝑎𝑙 𝑎𝑎𝑛𝑡𝑎𝑙 𝑛𝑖𝑒𝑢𝑤𝑒 𝑧𝑖𝑒𝑘𝑒𝑛 𝑖𝑛 𝑒𝑒𝑛 𝑏𝑒𝑝𝑎𝑎𝑙𝑑𝑒 𝑝𝑒𝑟𝑖𝑜𝑑𝑒
o 𝐼𝐷 = 𝑇𝑜𝑡𝑎𝑎𝑙 𝑎𝑎𝑛𝑡𝑎𝑙 𝑔𝑒𝑜𝑏𝑠𝑒𝑟𝑣𝑒𝑒𝑟𝑑𝑒 𝑝𝑒𝑟𝑠𝑜𝑜𝑛𝑠𝑗𝑎𝑟𝑒𝑛 𝑎𝑡 𝑟𝑖𝑠𝑘 𝑔𝑒𝑑𝑢𝑟𝑒𝑛𝑑𝑒 𝑑𝑒𝑧𝑒 𝑝𝑒𝑟𝑖𝑜𝑑𝑒
o De incidentie in een dynamische populatie wordt niet uitgedrukt ten
opzichte van het aantal leden op een bepaald tijdstip, maar ten opzichte
van de totale persoonstijd die is geobserveerd
o Dimensie → 1/jaar (jaar-1) en de waarden zullen tussen de 0 en oneindig
liggen
o Maat voor de snelheid waarmee nieuwe ziektegevallen in de populatie
ontstaan
- Verschil ID en CI → Open of dichte populatie

Sterftecijfers:
Een bijzondere vorm van incidentiecijfers waarbij sterfte zowel in een cohort als in een
dynamische populatie worden bestudeerd.
- In de beschrijvende epidemiologie wordt vrijwel altijd gekozen voor een
formulering in termen van CI
- 𝑀𝑜𝑟𝑡𝑎𝑙𝑖𝑡𝑒𝑖𝑡 𝑖𝑛 𝑔𝑒𝑣𝑎𝑙 𝑣𝑎𝑛 𝐶𝐼 𝑣𝑎𝑛 𝑠𝑡𝑒𝑟𝑓𝑡𝑒 =
𝑇𝑜𝑡𝑎𝑎𝑙 𝑎𝑎𝑛𝑡𝑎𝑙 𝑠𝑡𝑒𝑟𝑓𝑡𝑒𝑔𝑒𝑣𝑎𝑙𝑙𝑒𝑛 𝑖𝑛 𝑒𝑒𝑛 𝑏𝑒𝑝𝑎𝑎𝑙𝑑𝑒 𝑝𝑒𝑟𝑖𝑜𝑑𝑒
𝑇𝑜𝑡𝑎𝑎𝑙 𝑎𝑎𝑛𝑡𝑎𝑙 𝑝𝑒𝑟𝑠𝑜𝑛𝑒𝑛 𝑖𝑛 𝑑𝑒 𝑝𝑜𝑝𝑢𝑙𝑎𝑡𝑖𝑒 𝑤𝑎𝑎𝑟𝑢𝑖𝑡 𝑑𝑒𝑧𝑒 𝑠𝑡𝑒𝑟𝑓𝑡𝑒𝑔𝑒𝑣𝑎𝑙𝑙𝑒𝑛 𝑎𝑓𝑘𝑜𝑚𝑠𝑡𝑖𝑔 𝑧𝑖𝑗𝑛
𝑎𝑎𝑛 ℎ𝑒𝑡 𝑏𝑒𝑔𝑖𝑛 𝑣𝑎𝑛 𝑑𝑒 𝑝𝑒𝑟𝑖𝑜𝑑𝑒
- Letaliteitspercentage – Case-fatality rate – CFR
o Proportie van de incidentie patiënten met een bepaalde aandoening die
ten gevolge van die aandoening overlijdt in een bepaalde periode
𝑇𝑜𝑡𝑎𝑎𝑙 𝑎𝑎𝑛𝑡𝑎𝑙 𝑠𝑡𝑒𝑟𝑓𝑔𝑒𝑣𝑎𝑙𝑙𝑒𝑛 𝑑𝑜𝑜𝑟 𝑒𝑒𝑛 𝑏𝑒𝑝𝑎𝑎𝑙𝑑𝑒 𝑧𝑖𝑒𝑘𝑡𝑒
o 𝐶𝐹𝑅 =
𝑇𝑜𝑡𝑎𝑎𝑙 𝑎𝑎𝑛𝑡𝑎𝑙 𝑖𝑛𝑐𝑖𝑑𝑒𝑛𝑡𝑒 𝑝𝑎𝑡𝑖ë𝑛𝑡𝑒𝑛 𝑚𝑒𝑡 𝑑𝑒𝑧𝑒 𝑧𝑖𝑒𝑘𝑡𝑒
- Proportioneel sterftecijfer – Proportional mortality rate – PMR




4