Module 2: Protein Structure & Dynamics
2.1 Amino Acids
Leerdoelen:
De algemene structurele mogelijkheden van aminozuren. Kenmerken.
Chirality of amino acids.
Chemische klassen van aminozuren kennen. The chemical classes of amino acids, their
determining features, and which amino acids belongs to which class.
- Centrale C atoom: hier zitten alle zijketens aan vast.
Zijgroepen: aminogroep, carboxylgroep. beide zijn geïoniseerd (proton af) bij een fysologisch
pH. (= ongeveer 7).
- Zwitter – ion: molecuul wat positieve en negatieve lading heeft.
- De zijketens bepalen de eigenschappen (van het aminozuur). Hierdoor kunnen ze ook in
verschillende klassen ingedeeld worden.
- C - atoom is asymmetrisch wanneer er 4 verschillende zijketens aan vast zitten.
- Aminozuren zijn asymmetrisch 2 stereo isomeren.
- Bijzondere aminozuren:
Cystine heeft een S – H groep aan een zijketen. Deze kunnen disulfide bindingen vormen.
Glycine heeft in plaats van een zijketen, een (extra) H atoom eraan. hierdoor is glycine het
kleinste aminozuur. En het heeft geen asymmetrisch koolstofatoom, door twee H – atomen aan
het C atoom.
Proline heeft een gesloten ring structuur, en heeft dus geen vrije aminogroep.
- Belangrijk om te weten welke soort aminogroepen er bestaan:
namen kennen en aminozuren herkennen.
Bouwstenen van het Leven |12
2.1 Amino Acids
Leerdoelen:
De algemene structurele mogelijkheden van aminozuren. Kenmerken.
Chirality of amino acids.
Chemische klassen van aminozuren kennen. The chemical classes of amino acids, their
determining features, and which amino acids belongs to which class.
- Centrale C atoom: hier zitten alle zijketens aan vast.
Zijgroepen: aminogroep, carboxylgroep. beide zijn geïoniseerd (proton af) bij een fysologisch
pH. (= ongeveer 7).
- Zwitter – ion: molecuul wat positieve en negatieve lading heeft.
- De zijketens bepalen de eigenschappen (van het aminozuur). Hierdoor kunnen ze ook in
verschillende klassen ingedeeld worden.
- C - atoom is asymmetrisch wanneer er 4 verschillende zijketens aan vast zitten.
- Aminozuren zijn asymmetrisch 2 stereo isomeren.
- Bijzondere aminozuren:
Cystine heeft een S – H groep aan een zijketen. Deze kunnen disulfide bindingen vormen.
Glycine heeft in plaats van een zijketen, een (extra) H atoom eraan. hierdoor is glycine het
kleinste aminozuur. En het heeft geen asymmetrisch koolstofatoom, door twee H – atomen aan
het C atoom.
Proline heeft een gesloten ring structuur, en heeft dus geen vrije aminogroep.
- Belangrijk om te weten welke soort aminogroepen er bestaan:
namen kennen en aminozuren herkennen.
Bouwstenen van het Leven |12
